Bağışıklık sistemini oluşturan elemanlardan herhangi birinin yokluğu ya da işlev bozukluğuna bağışıklık sistemi hastalıkları denir. Bağışıklık sistemini oluşturan hücreler ya da proteinlerin eksikliğinde ya da fonksiyon bozukluklarında vücuda giren zararlı etkenlere karşı mücadelede zayıflık başlar.